Наше музейное собрание является научно организованной совокупностью предметов основного (музейного) и научно-вспомогательного фондов, обладающей системой средств научно-информационного обеспечения их учета, хранения, изучения и использования. На сегодняшний день основной фонд музея насчитывает 10000 тысяч единиц хранения, научно-вспомогательный около 3500 тысяч единиц.
На сегодняшний день фондохранилище оборудовано в соответствии с действующей инструкцией по учету и хранению музейных фондов.
Основу фонда МУК «Историко-краеведческий музей» составляют коллекции документов и фотографий, а также большая коллекция бытовых предметов 19—20 вв.
Коллекция документов представлена уникальным собранием древних актов, многочисленными краеведческими материалами, а также личными документами граждан нашего города. Так, например, в фондах нашего музея хранится личный архив известного скульптора Георгия Дмитриевича Алексеева, коллекция документов режиссера театра кукол им. Образцова Владимира Кусова, наградные документы участников Великой Отечественной войны и многое др.
Давно исчезнувшие уголки нашего города запечатлены фотографами и представляют ценность для воссоздания истории нашего края. Так, например, в фондах музея есть фотографии конца 19—начала 20 века, рассказывающие о жизни рабочих хлопкопрядильной фабрики и ее владельцах. Особое место в собрании музея занимает коллекция фотографий советского военного корреспондента В.А. Тёмина, прошедшего Великую Отечественную войну и принимавшего личное участие в освещении материалов Нюрнбергского процесса. В 2006 году музей приобрел уникальную коллекцию фотографий военного времени (не постановочные кадры), автором которых является личный фотограф Н.С. Хрущева — В. Дмитриевский.
На территории нашего городского округа расположены три усадьбы конца 18—начала 19 века (Горенки, Пехра-Яковлевское, Троицкое-Кайнарджи). Только в нашем музее можно увидеть образцы мебели из старинных городских усадеб, чудом уцелевших до наших дней.
Есть у нас коллекция наград времен Великой Отечественной войны, большинство которых принадлежат ветеранам — жителям нашего города.
Фонд нумизматики представлен в основном монетами 18—20-го вв. Есть и монета времени Петра I, деньга правления Анны Иоанновны, копейка 1779 года, серебряные монеты 19 века, первые денежные знаки СССР и др.
Основой фонда «Экспонаты природы» служит коллекция таксидермированной фауны (чучела животных и птиц) подаренная музею балашихинским краеведом Львом Алексеевичем Чухровым. В настоящее время она пополняется силами сотрудников музея. Палеонтологическая коллекция и коллекция насекомых, также собраны силами наших сотрудников.
Фондовая работа очень сложна и требует высокой профессиональной подготовки и большого терпения. Мы надеемся, что наша работа позволит сделать экспозиции музея еще более информативными и разнообразными.